Церковь во имя Рождества Богородицы была построена летом 1830 года. Церковь была освящена 21 сентября 1830 года, в праздник Рождества Пресвятой Богородицы, и являлась вторым храмом Мельничной обители.
После освящения храма Рождества Христова призвал к себе батюшка Серафим помещика Мантурова и сказал: «Худо мы, батюшка, с тобой сделали; ведь мы храм-то во имя Рождества Спасителя выстроили, а во имя Богородицы церкви-то у нас с тобой и нет! А Царица-то Небесная, батюшка, прогневалась на меня убогого Серафима и говорит: «Сына Моего почтил, а Меня позабыл!» Так вот что и удумал я, батюшка, нельзя ли внизу-то нам с тобою под церковью еще церковь сделать? Схлопочи-ка, батюшка, и будут у нас две церкви с тобою...» И архитекторы принялись за работу. Пришлось подкопать землю, так как свод потолка был низким, необходимо было поставить четыре каменных столба. Когда же доложили о 4-х столбах Батюшке, отец Серафим преисполнился радостью и в духовном восторге воскликнул: «Во-во, радость моя! Четыре столба - четверо мощей... Четыре столба - ведь это значит четверо мощей у нас, тут почивать будут! И это усыпальница мощей будет у нас, батюшка! Во, радость-то нам какая!»
В 1991 году после многолетнего перерыва опять зажглась неугасимая лампада, и с этого времени день и ночь сестрами читается неусыпаемая Псалтирь. Повторно церковь освящена 21 октября 1992 года.