В праздничные дни 19–22 августа 2001 года Соловецкую обитель посетили Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II и Президент России Владимир Владимирович Путин.
21 августа после Божественной литургии в Спасо-Преображенском соборе Святейший Патриарх Алексий II передал в дар монастырю частицу святых мощей святителя Филиппа, митрополита Московского и всея России, чудотворца. На следующий день 22 августа Всероссийским Первосвятителем был освящен восстановленный храм в честь святителя Филиппа, в алтаре которого и находится ныне ковчег с частицей его мощей.
После мученической кончины святителя Филиппа, умерщвленного 23 декабря 1569 года в Тверском монастыре опричником Малютой Скуратовым, тело святителя было спешно погребено в названном монастыре.
В 1591 году по ходатайству игумена Соловецкой обители Иакова гроб с нетленным телом святителя был перенесен из Твери в Соловецкий монастырь. Там он был положен под папертью Спасо-Преображенского собора в могилу, им самим приготовленную еще при жизни во время игуменства на Соловках и находящуюся около гроба его бывшего наставника и духовника, уставщика Соловецкой обители иеромонаха Ионы (Шамина).
31 мая 1646 года после получения игуменом Соловецкого монастыря Илией грамоты Патриарха Московского и всея Руси Иосифа о перенесении мощей святителя Филиппа, святые мощи первосвятителя были торжественно переложены в новую гробницу и поставлены в Спасо-Преображенском соборе Соловецкой обители.